Avrupa Parlamentosu Genel Kurulu 2009 Türkiye İlerleme Raporu'nu kabul etti.Raporda Kıbrıs sorunu,DTP'nin kapatılması ve Ergenekon Davası ön plana çıktı. Asker gitsin, Maraş bırakılsın Parlamento, Kıbrıs’ta süren müzakerelere “müdahil” olmaya yönelik görüşlerini de korudu ve geçen ay Dışişleri Komisyonu’nda belirttiği görüşlerinden geri adım atmayarak adadan "derhal" askerlerini çekmesi, adaya yerleşmiş Türk vatandaşları "sorununa" çözüm bulması ve Maraş bölgesini "meşru sahiplerine" iade etmesini istedi. Rapora sadece Yeşiller tarafından sunulan bir değişiklik önergesi eklenerek, çözüm için tüm taraflara “çaba göstermesi” çağrısı yapıldı. Kuzey Kıbrıs’a, AB’nin 2004’te yaptığı “izolasyonların kaldırılması” taahhüdünün hatırlatıldığı Türk kökenli Bulgar milletvekili Metin Kazak’ın sunduğu değişiklik önergesi ise reddedildi. Bunun yanısıra oylama öncesi konuşma yapan AB Komisyonu’nun yeni genişlemeden sorumlu temsilcisi Stefan Füle, izolasyonların kaldırılmasının çözümü kolaylaştıracağını belirtti. Bu arada aşırı sağ milletvekillerinin Türkiye ile müzakerelerin kesilmesine yönelik sunduğu değişiklik önergesi ise 44 e karşılık 555 oyla reddedildi. Raporda şu görüşler ön plana çıktı: -Türkiye, başta İran konusunda olmak üzere, dış politikasını AB ile koordinasyonlu yürütmeli, Ermenistan’la imzaladığı normalleşme protokollerini de ön koşul olmaksızın onaylamalı. -Türkiye’deki mevcuk “kutuplaşma” endişe verici. Bu çerçevede Türk hükümeti ve parlamentoda temsil edilen siyasi partiler, "siyasi rekabet ile işbirliği arasında uygun dengeyi bulmalı. -Kararda, siyasi partilerin kapatılmasının zorlaştırılması, silahlı kuvvetlerin tamamen sivil denetim altına alınması, Hakimler ve Savcılar Yüksek Kurulu'nun yapısının değiştirilmesi, dini azınlıklara tüzel kişilik statüsü verilmesi, Cem evlerinin ibadethane olarak tanınması, din derslerinin zorunlu olmaktan çıkarılması, Fener Rum Patrikhanesi'ne ekümenik sıfatını kullanma hakkı verilmesi ve Heybeliada Ruhban Okulu'nun "derhal" açılması gibi talepler arasında yer alıyor. DTP'nin kapatılması: Anayasa Mahkemesi'nin DTP'yi kapatma kararının eleştirildiği taslak kararda, PKK şiddeti kınanıyor ve örgütten, "Türk hükümetinin siyasi girişimine yanıt olarak", şiddete son vermesi ve silah bırakması isteniyor. Vergi cezası: Raporda ayrıca, Doğan Medya Grubu'na yönelik vergi cezası “emsalsiz ceza” olarak nitelendiriliyor ve "Basın özgürlüğünün çoğulcu bir toplumda önemli bir siyasi kültür göstergesi olduğu” vurgulanıyor. Devlet Bakanı ve Başmüzakereci Egemen Bağış, Avrupa Parlamentosu Genel Kurulu’nun onayladığı Türkiye Raporu’nun Kıbrısla ilgili bölümüne tepki gösterdi. Bağış, "Avrupa Birliği süreci Türkiye için çok önemlidir. Ancak Kıbrıs’ı feda edecek kadar önemli değildir. Kıbrıs milli davadır." dedi. Egemen Bağış, basın mensuplarının soruları üzerine, Avrupa Parlamentosu’nun onayladığı Türkiye Raporu’nu değerlendirdi. Egemen Bağış, bu kararın Avrupa Parlamentosu’ndaki siyasi grupların ortak düşünceleri ile alındığına dikkati çekti. Raporda, Türkiye’nin Avrupa Birliği sürecine ilişkin güzel ifadeler bulunduğunu belirten Bağış, kararın Kıbrıs’la ilgili bölümünü eleştirdi. "Adadan Asker Çekmek Gibi Bir Niyetimiz Yok" Türk askerinin Adadaki güvencenin ve huzurun çok önemli faktörü olduğuna dikkat çeken Bağış, şu an Türkiye’nin adadan asker çekmek gibi bir planı olmadığını vurguladı. Bağış, Kıbrıs’ta devam eden müzakerece sürecine Türkiye’nin desteğini hatırlatarak hükümetin her zaman barış için bir adım önde olduğunun altını çizdi.